本教材的主要内容有微生物学发展历程、食品微生物研究对象、微生物的基本形态与结构、微生物的营养与生长、微生物代谢、微生物遗传、微生物分类、微生物生态学、食品中的微生物、食物病原微生物、微生物与免疫、食品中的指示微生物、食品微生物学技术。其中食品中的指示微生物是因应于现代食品安全而设，国内外在此方面的教材基本都很少涉及，最后用食品微生物技术一章系统的介绍了为生物技术在食品上的应用，包括最新的技术都进行了讲述(教材的整体结构见附件1)。

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