《表4 分子对接打分结果:噻唑类葡萄糖激酶激动药的三维定量构效关系与理性设计》

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《噻唑类葡萄糖激酶激动药的三维定量构效关系与理性设计》


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注:-cdocker energy用于指示分子对接结果的分子作用能,-cdock-er interaction energy用于指示对接结果的配体-受体相互作用的结合自由能。

以GK为受体(PDB编号4isf)将上述30个设计得到的分子进行对接,使用Discovery Studio 3.5中的CDOCKER方法进行对接,参数设置:以晶体结构中配体分子所在区域半径12为对接约束范围,其余参数采用缺省值,对接pose选择保留各分子得分最高值,得到的对接结果见表4。结果显示:29号、18号、12号、2号分子对接结果较好,可能是优秀的GK激动药分子。