《表2 黄芪赤风汤中15个化合物分子对接打分值》
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《基于网络药理学和分子对接技术的黄芪赤风汤在化湿败毒方治疗新型冠状病毒肺炎中的作用》
SARS-Co V-2 3CL水解酶在病毒生命周期中发挥重要作用,COVID-19病毒以血管紧张素转化酶2作为受体侵入细胞导致肺损伤,因此认为SARS-Co V-2 3CL水解酶和血管紧张素转化酶Ⅱ(ACE2)可作为治疗COVID-19病毒的两个有效靶点。分子对接是通过几何匹配和能量匹配找到分子与靶点蛋白之间最佳匹配模式的过程,在SYBYL2.0软件的Dock系统中,一般认为打分值越大,结合越稳定,打分值>4.25说明分子与靶点有一定的结合活性,打分值>5.0说明结合活性较好,打分值>7.0说明有强烈的结合活性[8]。利用SYBYL2.0软件对中药—活性成分—靶点网络中自由度较大的前15个化合物进行分子对接,模拟分子20种构象与靶蛋白相互识别,找到最佳匹配模式并得出分值,黄芪赤风汤中连接靶点较多的前15个化合物中,有5个与SARS-Co V-2 3CL水解酶有一定结合活性,分别为:3,9-二-O-甲基尼森香豌豆紫檀酚、黄花菜木脂素A、豆甾醇、异鼠李素、毛蕊异黄酮(见表2);有8个与ACE2有一定结合活性,其中5个结合活性较好,分别为:槲皮素、异鼠李素、5-O-甲维阿斯米醇、常春藤皂苷元、黄花菜木脂素A、7-O-甲基-异微凸剑叶莎醇、豆甾醇、毛蕊异黄酮(见表2)。根据分子对接打分值排名前五的化合物与靶点蛋白的结合模式(见图6),表明这些化合物可以通过氢键与靶蛋白上一个或多个氨基酸结合发挥作用。
图表编号 | XD00208444300 严禁用于非法目的 |
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绘制时间 | 2020.12.26 |
作者 | 崔连杰、李科、秦雪梅、李震宇、杜昱光、王盛金 |
绘制单位 | 山西大学中医药现代研究中心、山西大学中医药现代研究中心、山西大学中医药现代研究中心、山西大学中医药现代研究中心、陵川县农业综合开发中心 |
更多格式 | 高清、无水印(增值服务) |