《表2 Rv3295与小分子对接打分情况》

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《结核分枝杆菌TetR家族蛋白Rv3295新调控靶点及辅助因子的初步研究》

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为了研究6种小分子（VB1、VB3、VB6、VC、Fe3+、Zn2+）与Rv3295之间潜在的分子结合模式，本研究进行了分子对接，由GB-VI/WSA dG评分估计的结合自由能表示蛋白与小分子的结合能力，较低的结合分数表示较高的结合亲和力。结果显示，VB1、VB3、VB6和VC主要形成氢键，Fe3+和Zn2+主要形成盐桥。Val 64和Leu 121与VB1相互作用（图6E)；Glu 67与VB3相互作用（图6F)；Glu 105与VB6相互作用（图6G)；Glu 105与VC相互作用（图6H)；Glu 67、Gln 102和Glu 105与Fe3+相互作用（图6I)；Glu 67、Gln 72和Ala 98与Zn2+（图6J）相互作用（表2）。表明Glu 67和Glu 105氨基酸残基在Rv3295与小分子及金属离子的相互作用中起重要作用。