《表2 综合打分前9的小分子的名称, 额外精度打分及类药五原则相关指标》
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《基于分子对接探讨红芪中小分子拮抗肿瘤坏死因子受体1的可能性》
注:能量均以千卡/摩尔为单位。
以额外精度打分(XP docking)为准,将打分靠前的小分子,根据类药五原则[14]进一步筛选。符合筛选类药分子的5条基本规则的化合物会有更好的药代动力学性质,在生物体内代谢过程中会有更高的生物利用度,因而也更有可能成为口服药物。将43个红芪成分与TNFR1进行对接,以XP docking为准,符合类药五原则且排名前9位的化合物见表2。通过XP docking高精度筛选红芪的有效成分即目标化合物,发现红芪中槲皮素,异甘草素,柚皮素,2-(2-羟基-4-甲氧基苯基)-6-甲氧基-1-苯并呋喃-5-醇,毛蕊异黄酮,2-(2-羟基-4-甲氧基苯基)-1-苯并呋喃-6-醇,龙胆山酮酚以及甘草素均具有与TNFR1对接的可能。
图表编号 | XD0086302500 严禁用于非法目的 |
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绘制时间 | 2019.09.05 |
作者 | 李研、骆亚莉、刘永琦、冯彩琴、靳晓杰、朱永昌 |
绘制单位 | 甘肃中医药大学甘肃省高校重大疾病分子医学与中医药防治研究省级重点实验室、甘肃中医药大学甘肃省高校重大疾病分子医学与中医药防治研究省级重点实验室、甘肃中医药大学敦煌医学与转化省部共建教育部重点实验室、甘肃中医药大学甘肃省高校重大疾病分子医学与中医药防治研究省级重点实验室、甘肃中医药大学敦煌医学与转化省部共建教育部重点实验室、甘肃中医药大学甘肃省高校重大疾病分子医学与中医药防治研究省级重点实验室、甘肃中医药大学药学院、兰州大学应用有机化学国家重点实验室 |
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