《表1 印度谷螟样品转录组数据评估统计》

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《印度谷螟转录组测序及功能注释分析》


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注:印度谷螟样品编号VA为未交配成虫;MA为已交配成虫;L为幼虫;P为蛹。Raw reads为统计原始序列数据;Clean reads为过滤后的测序数据;Clean bases为测序序列的个数乘以测序序列的长度,并转化为以Gb为单位。Error rate为碱基错误率;Q20、Q30为Phred数值大于20、30的碱基占

为明确嗅觉基因在印度谷螟不同发育阶段的功能及其对印度谷螟(交配、未交配)成虫生理行为的影响,对印度谷螟幼虫、蛹、成虫(交配、未交配)转录组进行测序,通过过滤除杂后,分别获得(51.64±5.77)×106条、(53.42±4.12)×106条、(52.23±5.25)×106条和(53.37±3.14)×106条clean reads,且各样品clean reads均达到7.2 Gb以上,合计94.82 Gb (GenBank登录号SRP154493)有效转录组数据。样本GC含量在44.52%~46.73%之间,Q20碱基含量在95.90%~96.63%之间,Q30碱基比例均大于90.31%(表1)。数据显示测序质量好,可信度高。