《表1 印度谷螟样品转录组数据评估统计》
注:印度谷螟样品编号VA为未交配成虫;MA为已交配成虫;L为幼虫;P为蛹。Raw reads为统计原始序列数据;Clean reads为过滤后的测序数据;Clean bases为测序序列的个数乘以测序序列的长度,并转化为以Gb为单位。Error rate为碱基错误率;Q20、Q30为Phred数值大于20、30的碱基占
为明确嗅觉基因在印度谷螟不同发育阶段的功能及其对印度谷螟(交配、未交配)成虫生理行为的影响,对印度谷螟幼虫、蛹、成虫(交配、未交配)转录组进行测序,通过过滤除杂后,分别获得(51.64±5.77)×106条、(53.42±4.12)×106条、(52.23±5.25)×106条和(53.37±3.14)×106条clean reads,且各样品clean reads均达到7.2 Gb以上,合计94.82 Gb (GenBank登录号SRP154493)有效转录组数据。样本GC含量在44.52%~46.73%之间,Q20碱基含量在95.90%~96.63%之间,Q30碱基比例均大于90.31%(表1)。数据显示测序质量好,可信度高。
图表编号 | XD0088488600 严禁用于非法目的 |
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绘制时间 | 2019.08.20 |
作者 | 李慧、涂斌、于英威、彭峻、王殿轩 |
绘制单位 | 河南工业大学粮油食品学院粮食储藏与安全教育部工程研究中心粮食储运国家工程实验室、河南工业大学粮油食品学院粮食储藏与安全教育部工程研究中心粮食储运国家工程实验室、国家粮食和物资储备局标准质量中心、河南工业大学粮油食品学院粮食储藏与安全教育部工程研究中心粮食储运国家工程实验室、河南工业大学粮油食品学院粮食储藏与安全教育部工程研究中心粮食储运国家工程实验室 |
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