《表5 印度谷螟SSR位点统计》

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《印度谷螟转录组测序及功能注释分析》

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SSR标记目前已广泛应用于基因连锁与遗传图谱构建、目标基因的标定、指纹图的绘制、遗传多样性及品种鉴定等研究。本研究通过SSR位点挖掘后共鉴定出31 301个SSRs（总计116 399条Unigenes），平均长度14.56 bp，分布在23 681条Unigenes序列中，出现频率26.89%，发生频率20.34%。同时发现有174种重复基元类型，其中单核苷酸、二核苷酸、三核苷酸、四核苷酸、五核苷酸和六核苷酸重复的SSR数量分别为21 552个、6 054个、3 287个、362个、15个和31个，单核苷酸和二核苷酸所占比例最大，分别为68.85%和19.34%，五核苷酸SSR数量最少，约占0.05%。SSR重复单元的重复次数分布在5～25次之间，其中10次重复的最多，有12 979个SSR，占41.47%；其次为11次和6次重复，分别有4 433、3 747个SSR，分别占14.16%和11.97%；重复次数最少的为25次，仅有1个SSR（表5）。