《表3 银杏SBP基因家族信息》

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《银杏SQUAMOSA启动子结合蛋白(SBP)基因家族的鉴定及表达分析》


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在转录组数据库鉴定出15个银杏SBP基因家族成员,并依据转录本编号将基因分别命名为GbSBP1~GbSBP15,如表3所示。以银杏基因组作为参考基因组,将15个银杏SBP家族基因与参考基因组进行序列比对,获取基因在染色体上的位置和分布信息,分析发现15个SBP基因在染色体上分布较分散,除3个基因GbSBP3、GbSBP4、GbSBP5分布于同一位置scaffold11982外,其余基因均分布于不同染色体位置,基因位点为scaffold98~scaffold35666之间,GbSBP15位于scaffold98,GbSBP7位于scaffold35666。此外,scaffold11982处的3个基因匹配区段极不均匀,主要集中在357~850 kb之间。