《表1 实时荧光定量PCR引物信息》

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《福清山羊与努比亚黑山羊发情期卵巢组织RNA-Seq分析》


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为了进一步验证高通量测序结果以及发现新转录本序列的准确性,以18S rRNA为内参基因,随机挑选6个DEGs和2个新转录本,采用实时荧光定量PCR(qRT-PCR)验证基因表达量。内参基因引物参考文献设计[21],其余基因和新转录本引物根据测序序列信息由ABI公司的Primer Express Software v2.0设计,铂尚生物技术(上海)有限公司合成,基因名称及引物信息见表1。以1.2中各样品RNA池为模板,采用TAKARA PrimeScript?RT reagent Kit with g DNA Eraser(TaKaRa,大连宝生物)试剂盒逆转录后进行qRT-PCR扩增,扩增体系20μL:c DNA模板1μL,上、下游引物各1μL,2×SYBR?Select Master Mix 10μL,ddH2O7μL。q RT-PCR扩增程序:95℃预变性2 min;95℃变性10s,60℃退火10s,72℃延伸40s,50个循环;最后72℃延伸5min;4℃保存。采用2-ΔΔCt法计算基因的相对表达量。