《表2 基于DNA甲基化的法医学年龄预测模型总结[29]》

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《DNA甲基化检测与生物物证时间关联性研究进展》


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注:MLRM为多元线性回归模型(Multivariate linear regression model),MQDRM为多元二次回归模型(multivariate quadratic regression model),MQTRM为多远分位数回归模型(multivariate quantile regression model),ANN为人工神经网络模型 (ANN)

在法医学中,个体年龄推断一直是法医学研究的重点和难点,年龄的确定可以缩小嫌疑人的范围,为案件侦查提供重要的线索[19-20]。当前推断个体年龄主要是通过检测骨骼、牙齿等骨性指征,并运用法医人类学模型计算进行[21-22]。但实际案例中,法医人类学技术的应用会由于骨骼检材的缺失而受限,此时通过其他生物组织来推断个体年龄就显得尤为重要。近年来,表观遗传学研究发现,DNA甲基化与衰老之间存在着密切相关性[23]。早期研究表明,全基因组DNA甲基化水平在个体的最初几年是随年龄而增加的,在成年后开始下降[24]。基因芯片和新一代测序技术的出现,促进了大样本全基因组范围的甲基化检测,发现一些特定的CpG位点与年龄呈现出高度的关联性,可据此建立模型而预测个体年龄[25-26]。针对法医遗传学应用的预测模型目前也有了大量研究报道。Freire-Aradas等[27]研究725个欧洲个体DNA甲基化水平,发现7个DNA甲基化位点与年龄具有高度关联性,并建立了多元分位数回归模型,误差为±3.07岁,其中3个位点DNA甲基化与年龄成正相关,而另外4个成负相关,预测年龄与实际年龄之间的偏差随着实验对象年龄的增加而增加。Zbiec-Piekarska等[28]用焦磷酸测序技术分析了Hannum等人报道的8个候选基因座,检测了420份个体样本的41个CpG位点的DNA甲基化水平,并用其中300份样本建立了基于5个DNA甲基化位点的年龄预测模式的线性回归方程,R2=0.94,用剩下的120份样本验证该模型,平均绝对偏差为±3.9岁,将样本按年龄大小分为4组:2~19、20~39、40~59、60~75岁,四个年龄组的平均绝对偏差随着年龄的增加而增大,且预测正确性能随着年龄增加而下降,其中误差在±5岁以内的准确性为86.7%(2~19岁样本)和50%(60~75岁样本)。就亚洲样本而言,韩国Park等[19]通过对公用数据库中1415份450K DNA甲基化芯片数据进行统计分析,筛选出3个DNA甲基化位点,并在535份样本中构建多元线性回归模型,使用230份样本进行验证,误差为±6.853岁,对于60岁以下的个体年龄推断的准确性为77.3%。表2是最近几年有关DNA甲基化与个体年龄之间的相关研究。