《表1 甘蓝BoPINs家族蛋白信息》

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《甘蓝BoPINs家族基因的特征和表达分析》

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通过拟南芥数据库At PINs家族的氨基酸序列进行BLASTp比对（取E-value≤1×10–20），结合甘蓝基因组数据库序列，从甘蓝基因组数据库中共鉴定出8个BoPINs家族基因[13-15]。根据它们的染色体位置，将BoPIN1、BoPIN3和BoPIN7的同源拷贝依次命名为BoPIN1-1、BoPIN1-2、BoPIN3-1、BoPIN3-2、BoPIN7-1和BoPIN7-2。其编码多肽链的氨基酸残基数在350～650之间，相对分子质量为38～70 kD。编码氨基酸链最长的是BoPIN2，其相对分子质量为70.46 kD；编码氨基酸链最短的是BoPIN8，其相对分子质量为38.22 kD。BoPINs蛋白的理论等电点（pI）在6～9之间。不稳定系数分析发现，大部分BoPINs蛋白为稳定蛋白（不稳定系数小于40），只有BoPIN1-1和BoPIN5属于不稳定蛋白。根据亲水性指数（GRAVY为负值表示亲水性，正值表示疏水性，介于-0.5～+0.5的为两性蛋白）的原则，发现BoPIN5和BoPIN8蛋白为疏水性蛋白，其余BoPIN家族蛋白均为两性蛋白[16]。亚细胞定位预测分析表明，BoPIN1-1、BoPIN1-2、BoPIN2、BoPIN3、BoPIN4、BoPIN7-1和BoPIN7-2定位于细胞膜；BoPIN5、BoPIN6和BoPIN8定位于内质网[17-18]（表1）。SignalP在线工具分析显示，BoPINs家族蛋白都不存在信号肽，均为非分泌型蛋白。