《表4 宏基因组序列分析结果1)》

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《对污水处理厂中大肠杆菌的四环素耐药性分析》

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1)tet（E）、tet（G）、tet（H）、tet（J）、tet（O）、tet（P）、tet（Q）、tet（R）、tet（S）、tet（T）、tet（U）、tet（V）、tet（W）、tet（X）、tet（Y）、tet（Z）、otr（A）、tcr（3）、tet（31）、tet（32）、tet（34）、tet（35）、tet（36）、tet（37）、tet（39）、tet（40）、tet（41）、tet（43）和tet（44）等四环素类耐

为进一步揭示四环素耐药菌和敏感菌的耐药基因，并与PCR的检测结果进行对比分析，采用宏基因组学方法对所选取的大肠杆菌菌株进行高通量测序．通过NovaSeq平台测序和序列质量控制，每个提取的DNA样品得到19 954～77 434条序列，力求每个大肠杆菌菌株的基因组测序覆盖度达到10倍以上．用ARG-OAP（v2.0）平台分析序列，得到四环素耐药基因的类型和数量（表4）．由表4可见，在这4个水样中，耐药菌和敏感菌均检测到tet（A），耐药菌中所含的耐药基因的类型和数量较敏感菌更多．此外，样品中除了检测到四环素耐药基因外，还检测到大环内酯类、喹诺酮类和磺胺类等多种抗生素耐药基因．与传统PCR技术相比，宏基因组学方法能更快且更高效地检测到多种四环素抗性基因，为后续研究其他抗生素的耐药基因提供了方法．目前已有对于不同耐药基因联合作用的相关研究[28]，但不同耐药基因对抗生素耐药性的表达有何具体影响，以及耐药基因联合作用的机理还有待进一步研究．