《表2 宏基因组分析常用软件和数据库》

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《微生物组数据分析方法与应用》

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近年来，鸟枪法宏基因组（shotgun metagenomic）测序随着通量提高和价格下降得到了进一步发展，随之而来的是大量相关软件的研发和发表（表2）。较扩增子测序相比，宏基因组测序不仅能获得无偏的物种组成，还得获得研究对象的功能组成，甚至能拼接出部分微生物的基因组草图。