《表2 TRIM63氨基酸序列同源性比对》

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《泥鳅二倍体与四倍体trim63a基因的克隆及表达分析》

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利用BioEdit软件将Ma-Trim63a的氨基酸序列与其他脊椎动物进行多重序列比对分析。比对结果显示，Ma-Trim63a与其他硬骨鱼类的序列相似度较高，其中，与斑马鱼的序列相似度最高为85%，其次与大西洋鲑的序列相似度为70%。与哺乳动物序列相似程度较低，与小鼠（Mus musculus）序列相比的相似程度仅有54%（表2）。但Ma-Trim63a与其他物种蛋白质结构功能域保守性较高（图4）。对11种脊椎动物TRIM63的核苷酸序列进行的系统进化树构建，结果如图5所示：泥鳅的MaTrim63a与斑马鱼Trim63a在进化上亲缘关系最近，并形成一个分支，然后与其他硬骨鱼类聚为一支，最后与哺乳动物、鸟类和两栖动物聚为一支。