《表4 CL500.Contig1, 3, 4_All同源基因信息》
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《响应地黄连作障碍LncRNA-RgAGT2的克隆及表达分析》
为分析其潜在功能,将Unigene29334_All全长序列与地黄转录组数据(登录号SRX269426)进行比对分析,检测到与其部分区域高度同源的3个转录本,CL500.Contig1_All,CL500.Contig3_All和CL500.Contig4_All(图3)。进一步利用NCBI数据库Blast对CL500.Contig1_All,CL500.Contig3_All和CL500.Contig4_All同源区域进行功能分析证实,上述3个转录本与芝麻丙氨酸-乙醛酸转氨酶2同源基因3(Sesamum indicum alanine-glyoxylate aminotransferase 2 homolog 3,SiAGT2)存在较高同源性(表4,图4),可以判断CL500.Contig1_All,CL500.Contig3_All,CL500.Contig4_All为地黄丙氨酸-乙醛酸转氨酶2(RgAGT2)同源基因,因此,将Unigene29334_All命名为LncRNA-RgAGT2。
图表编号 | XD0062705300 严禁用于非法目的 |
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绘制时间 | 2019.02.15 |
作者 | 王潇然、王玉红、李炜玺、李振、刘方明、张重义、陈新建 |
绘制单位 | 河南农业大学生命科学学院、河南农业大学生命科学学院、河南农业大学生命科学学院、河南农业大学生命科学学院、河南农业大学林学院、福建农林大学作物科学学院、河南农业大学生命科学学院 |
更多格式 | 高清、无水印(增值服务) |