《表2 羚牛Tas2R3基因不同区域核苷酸 (DNA) 及其氨基酸 (AA) 序列的总长度及变异位点数》
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《羚牛苦味受体3(Tas2R3)基因的克隆及生物信息学分析》
同时,进一步对Tas2R3基因CDS区核苷酸序列(951 bp)进行比对,共检测出420个核苷酸变异位点,占总位点的44.16%。其中单核苷酸变异位点141个,占总变异位点的33.57%,占总位点的14.83%;简约信息位点279个,占变异位点总数的66.43%,占总位点的29.34%。对氨基酸序列(316 aa)进行比对(图2),共检测出182个氨基酸变异位点,占总氨基酸数的57.59%。其中,单个氨基酸变异位点45个,占变异位点的24.73%,占总氨基酸位点的14.24%;简约信息位点137个,占变异位点的75.27%,占总氨基酸位点的43.35%。为了进一步对变异位点分布情况的分析,研究人员对羚牛Tas2R3基因编码蛋白的胞外区、跨膜区和胞内区核苷酸和氨基酸的变异位点进行了统计,结果显示,核苷酸变异位点数量占各个区域总核苷酸数量的比例分别为51.96%、43.01%、40.43%,氨基酸变异位点数占各区域总氨基酸残基的比例分别位64.71%、59.36%、50.54%(表2)。可以看出,羚牛Tas2R3基因核苷酸和氨基酸的变异率都主要分布在胞外区,依次是跨膜区和胞内区。
图表编号 | XD0062423400 严禁用于非法目的 |
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绘制时间 | 2019.05.25 |
作者 | 周明、余姣姣、李彪、欧阳菠、杨建东 |
绘制单位 | 四川农业大学动物科技学院、四川农业大学动物科技学院、四川农业大学动物科技学院、四川农业大学动物科技学院、四川农业大学动物科技学院 |
更多格式 | 高清、无水印(增值服务) |