《表1 HPV16E6基因核苷酸序列突变及预测氨基酸序列变异》

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《中国攀西地区HPV16病毒E6/E7基因多态性分析》

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本次研究成功扩增并测序得到57个样本的特异E6、E7基因序列。将获得的序列与HPV16原型序列（欧洲原型NC＿001526.4）进行比对，得到了样本HPV16E6、E7基因的核酸序列变异情况（表1、2）。本次研究在E6、E7基因中共观察到16种核苷酸变异，包含9种错义突变和7种同义突变。E6基因总体突变率为12.3%（7/57），其中6种均为错义突变，包括C233T、T268G、A360C、G387T、415delT和G422C（表1）。预测这些碱基突变可导致E6基因发生下列氨基酸变异:丝氨酸-苯丙氨酸（S78F）、亮氨酸-缬氨酸（L90V）、谷氨酸-天冬氨酸（E120D）、赖氨酸-天冬酰胺（K129N）、甘氨酸-丙氨酸（G141A），另有415位碱基缺失导致氨基酸序列从第139位开始出现移码突变。E7基因总体突变率为94.7%（54/57），其中3种均为错义突变，包括A85C、A86G和C188T（表2）。预测这些碱基可导致下列氨基酸变异:天冬酰胺-组氨酸（N29H）、天冬酰胺-丝氨酸（N29S）、丝氨酸-苯丙氨酸（S63F）。其余E7基因的碱基改变不导致氨基酸替换，为同义突变。最常见的变异是E7基因的A86G（41/57，71.9%）和T285C（40/57，70.2%），与E6中的突变单个出现明显不同。在7例样本中同时发现E6、E7基因的突变，但变异类型组合各不相同。