《表1 已知植物LAR基因的NCBI登录号,c DNA长度及其编码的氨基酸序列长度》

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《芒果LAR cDNA的电子克隆及序列分析》


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以葡萄LAR基因序列为探针,采用BLASTn在NCBI非冗余数据库中检索到其他植物的LAR同源序列(表1)。对获得的LAR同源基因序列末端的200~300 bp序列进行同源性分析,获得保守序列。然后,用此保守序列,在NCBI SRA和TSA数据库中检索同源序列。经CLUSTW对获得的同源序列进行分析、比对,获得了最长的芒果LAR CDS序列(1 149 bp),其开放阅读框为1 059 bp,编码352个氨基酸(图1)。