《表1 胡黄连GPPS氨基酸序列与NCBI中已知植物GPPS序列比对结果》

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《胡黄连GPPS基因的生物信息学分析》


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由表1可知,经比对分析获得序列相似度较高的20条不同物种中的氨基酸序列。其中,胡黄连GPPS氨基酸序列与小花茉莉GPPS氨基酸序列相似性高达77%。利用DNAMAN软件将胡黄连GPPS氨基酸序列与其中相似性较高的9条GPPS氨基酸序列进行多序列比对,结果表明,胡黄连中的GPPS蛋白和其他物种中GPPS蛋白在保守区结构域上相似度很高(图3)。