《表2 胡麻SUC蛋白二级结构》

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《胡麻SUC基因家族的鉴定与生物信息学分析》


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比较分析12个胡麻SUC蛋白序列,结构显示不同的蛋白差异较大。蛋白长度为252 (LuSUC8)~952 aa (LuSUC4),分子量为26 863.30 (LuSUC8)~101 956.83 Da (LuSUC4),等电点为5.99 (LuSUC10)~9.42 (LuSUC3),糖基化位点为0 (LuSUC7、LuSUC8)~5 (LuSUC10),跨膜结构域为6 (LuSUC7、LuSUC8)~13 (LuSUC5)。对上述序列进行信号肽预测,发现所有序列均无信号肽。亚细胞定位预测结果显示,所有基因都定位在细胞膜,其中Lu SUC3和Lu SUC4除细胞膜外还定位在叶绿体、细胞质、细胞核中。在胡麻的12个SUC蛋白二级结构中,α-螺旋所占比例最大(41.58%),其次为无规卷曲(37.48%)、β-折叠(16.62%)、β-转角所占比例最小(4.78%)(表2)。