《表2 气单胞菌参考序列GenBank编号》

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《3种方法鉴定气单胞菌临床分离株效果分析》


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采用细菌基因组DNA提取试剂盒提取气单胞菌基因组DNA作为PCR模板,扩增气单胞菌7个管家基因(gyrB、rpoD、recA、dnaJ、gyrA、dnaX和atpD),引物参考文献[7,9],使用DNAStar软件对管家基因进行测序,序列按照标准参考文献[7]序列进行剪切和拼接,串联起来用MEGA 5.0软件进行系统进化树分析,采用Clustal-W进行序列比对,参数选择Clustal-W和Neighbour-Joining,Bootstrap值为1 000。当测试序列与参比序列聚类在同一个进化树分支时,则将此测试序列代表的菌株鉴定为该种气单胞菌[10]。参考序列GenBank编号见表2。