《表1 GenBank中可用的嗜水气单胞菌噬菌体(截止2020年4月1日)》
截止2020年4月1日,GenBank共收录44株嗜水气单胞菌噬菌体的全基因组序列(表1)。这些噬菌体大多从水环境中分离得到,主要来自中国、韩国、波兰、俄罗斯、美国、澳大利亚和印度7个国家。其中,有23株属于肌尾噬菌体科(Myoviridae),占52.3%;12株属于短尾噬菌体科(Podoviridae),占27.3%;6株属于长尾噬菌体科(Siphoviridae),占13.6%;另有Ahp2属于丝状噬菌体科(Inoviridae),62AhydR11PP和嗜水气单胞菌噬菌体44572基因组则尚未确定分类地位。已报道的嗜水气单胞菌噬菌体基因组大小差异显著,其中肌尾噬菌体科具有较大的基因组,为45~262kb,且大于200kb的居多;短尾噬菌体科为30~97kb,多数为42kb;长尾噬菌体科基因组大小为45~115kb;丝状噬菌体科的Ahp2为47kb;未分类的62AhydR11PP和44572基因组大小分别为43kb和102kb。从核酸结构看,44株嗜水气单胞菌噬菌体中,只有pAh6-C、2L372X、MJG、LAh6和44572为环状DNA,其余39株均为线状DNA。
图表编号 | XD00189231900 严禁用于非法目的 |
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绘制时间 | 2020.11.15 |
作者 | 成亚辉、王子艺、高栋业、肖炜、张仕颖 |
绘制单位 | 云南农业大学云南省土壤培肥与污染修复工程实验室、云南农业大学云南省土壤培肥与污染修复工程实验室、云南农业大学云南省土壤培肥与污染修复工程实验室、云南大学云南省微生物研究所、云南农业大学云南省土壤培肥与污染修复工程实验室 |
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