《表2 本研究使用的参考菌株及其GenBank登录号》

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《广东甘薯疮痂病病原菌鉴定》


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下载GenBank中已公布的痂囊腔菌属(Elsino?)代表性菌株的ITS、LSU、rpb2和TEF1序列(表2),利用ClustalW对各目的序列进行比对分析,通过手工校正序列,将校正后的上述4个序列按照首尾相连方法拼接后进行多重比对分析后,使用MEGA 5.2进行聚类分析。以Myriangium hispanicum为外群,采用最大似然法和T92+G+I模型,构建多基因系统发育进化树,以Bootstrap进行1000次重复检验,估算分支的自展支持率,分析其系统发育进化关系。