《表4 烟草赤星病菌菌株GenBank登录号》

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《吉林省和黑龙江省烟草赤星病病原鉴定》


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为了进一步对形态学鉴定结果的准确性进行证实,从每种烟草链格孢中挑选出两个代表菌株进行多基因序列片段(ITS、GPD、EF、ACT、RPB2)测序,在NCBI上获得GenBank登录号(表4)。结果发现4种链格孢在ITS、EF、ACT 3种基因序列中没有明显差异,不能进行区分,基于GPD基因序列构建系统发育树(图4),能很好的区分出A.alternata和A.tenuissima 2种链格孢,并与形态学鉴定结果相符。基于RPB2基因序列构建系统发育树(图5),形态学上鉴定为A.alternata的菌株JDD14-3、JYD3-1与标准菌株LC132699.1(A.alternata)聚在一个分枝,形态学上鉴定为A.tenuissima的菌株JBT1-6、JBT2-2与标准菌株LC134315.1(A.tenuissima)聚在一个分枝,形态学上鉴定为A.longipes菌株HZYD4-3-2、HHN3-6与标准菌株KY 056664.1(A.longipes)汇聚的一个分枝,形态学上鉴定为A.yaliinficiens的菌株JBT2-1、JYY2-6单独聚在一个分枝。分子鉴定结果与形态学鉴定的结果一致。