《表1 烟草COMT氨基酸序列的亚细胞定位》
注:Len表示序列长,cTP表示叶绿体转运肽,mTP表示线粒体靶向肽,SP表示信号肽,other表示其他位置,Loc表示定位结果,RC表示可靠性等级。
为明确烟草COMT在具体的亚细胞结构中发挥作用,进而对烟草COMT进行亚细胞定位,结果如表1所示。Nt COMT1、Nt COMT2和Nt COMT3均含有信号肽的信号,分别为0.041、0.037和0.089,但信号强度较为微弱,通过定位结果Nt COMT1可能位于叶绿体和其他位置,因其他位置的概率大于叶绿体,为此,通过PSORT分析,位于细胞质的值为7,位于叶绿体的值为3,因此推断Nt COMT1可能在细胞质中发挥作用;Nt COMT2位于叶绿体的概率值为0.550,而位于其他位置的概率值为0.628,通过进一步分析,位于细胞质的值为7,叶绿体的值为2,从而推断Nt COMT2可能位于细胞质中;Nt COMT3的位于叶绿体的概率值为0.103,其值明显小于位于其他位置的概率值为0.784,但同通过PSORT的分析,位于叶绿体的值为6,位于内质网的值为3,位于细胞核、细胞质、线粒体的值和位于细胞膜上的值均为1,尽管定位于其他位置的概率值较大,但类型较多,相应的分值较低,因此推断Nt COMT3定位于叶绿体中。
图表编号 | XD0052326900 严禁用于非法目的 |
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绘制时间 | 2019.03.27 |
作者 | 蔡进宇、李振、王玉珍、杨志孝、吴杰、苏家恩 |
绘制单位 | 大理州烟草公司大理市分公司、大理州烟草公司漾濞县分公司、大理州烟草公司云龙县分公司、大理州烟草公司大理市分公司、大理州烟草公司洱源县分公司、云南省烟草公司大理州公司 |
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