《表1 Nt BGl的亚细胞定位》

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《"烟草β-1,3-葡聚糖酶的特性和结构分析"》


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注:RC表示可靠性级别(1~5),“1”的可靠性最强Note:RC was the level of reliability(1-5),and“1”was the most reliable

为明确Nt BGl属于4种类型的哪几种,以及在特定的亚细胞中发挥作用,依据氨基酸序列的信号肽对Nt BGl进行亚细胞定位。由表1可知,序列长度为359 aa的Nt BGl-1,在第21位存在切割位点(概率为0.967),根据信号肽判断Nt BGl-1可能定位于液泡或细胞外,但定位于液泡的分值(4.0)大于细胞外(1.0),因此Nt BGl-1定位于液泡;Nt BGl-2的序列长度为370 aa,于第32位处存在切割位点(概率为0.838),定位于液泡内,其可靠性相对较低,级别为2;Nt BGl-3定位于细胞外,其切割位点位于343 aa的第29号,概率最大(0.991),且级别为1。Nt BGl二级结构在一定程度上决定高级结构,影响蛋白序列的功能,为此,对Nt BGl序列的无规则卷曲、β-折叠、β-转角和α-螺旋组成含量进行分析。由图2可知,Nt BGl-1、Nt BGl-2和Nt BGl-3的无规则卷曲分布无规律可寻,其所占比例依次为31.75%、33.78%、31.78%;Nt BGl-1和Nt BGl-2的β-折叠相对集中,而Nt BGl-3较为分散,所占比例依次为21.73%、21.35%、20.12%;β-转角于整个序列中所占的比例最小,依次为10.31%、9.73%、12.83%;Nt BGl-1和Nt BGl-2的α-螺在序列中表现为每隔50个氨基酸出现1次较为集中的α-螺序列,而Nt BGl-3仅表现在中间和C端区域,Nt BGl的α-螺所占比例最大,分别为36.21%、35.14%、35.28%。