《表1 FAM19A4及ACTB基因的引物及探针序列》
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《FAM19A4基因启动子甲基化在高危型HPV阴性宫颈癌诊断中的作用》
美国ABI 7500型实时荧光定量PCR系统(Life Tech)用于进行实时荧光定量PCR技术检测样本中FAM19A4基因的甲基化情况。以hr-HPV阳性宫颈癌FFPE-DNA、hr-HPV阴性宫颈癌FFPE-DNA、双蒸水分别作为阳性对照、阴性对照和空白对照模板。反应体系共20μL,主要包括:2×Premix Type试剂10μL;50×Rox Reference Dye II试剂0.2μL;FAM19A4基因上、下游引物各0.5μL;ACTB内参基因上、下游引物各0.5μL;FAM19A4基因及ACTB内参基因探针各0.8μL;纯水5.2μL;样本量1μL(FAM19A4基因及ACTB内参基因的引物及探针序列如表1所示)。PC反应条件:95°C预变性3 min;然后95℃变性15 s,56℃退火20 s及65℃延伸40 s,共进行50个循环。每个样本均进行了3次重复试验。扩增结果判定:荧光定量PCR技术扩增后,经ABI 7500收集荧光信号,获得内参基因和目标基因的循环阈值(CT值)及扩增曲线,计算两基因CT值间的阈值差(ΔCT),综合判定不同样本的甲基化程度。以ACTB为内参,计算ΔCT=CT目标基因-CT内参,并同时结合扩增曲线判断甲基化情况,且ΔCT值越小,扩增曲线目标基因越早扩增,表示基因甲基化水平越高。
图表编号 | XD0042340000 严禁用于非法目的 |
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绘制时间 | 2019.03.10 |
作者 | 伍恒英、彭苏珺、布俏雯、张亮、王三锋、雷雯、李辉斌、马健、罗喜平 |
绘制单位 | 广州医科大学附属广东省妇幼保健院妇科、广州医科大学附属广东省妇幼保健院妇科、广州医科大学附属广东省妇幼保健院妇科、广州医科大学附属广东省妇幼保健院妇科、广州医科大学附属广东省妇幼保健院妇科、广州医科大学附属广东省妇幼保健院妇科、广州医科大学附属广东省妇幼保健院妇科、广州医科大学附属广东省妇幼保健院妇科、广州医科大学附属广东省妇幼保健院妇科 |
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