《表3 主要OTU分布及物种信息》

《表3 主要OTU分布及物种信息》   提示:宽带有限、当前游客访问压缩模式
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《应用Illumina MiSeq测序技术比较风干肉中细菌多样性和微生物安全性》


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由表3可知,group A、group B、group C、group D四组样品中,丰度值最高的为OTU 1,序列数占比为37%,物种信息为厚壁菌门(Firmicutes)乳杆菌属(Lactobacillus)的清酒乳杆菌(Lactobacillus sakei),OTU 5和OTU 2所包含的序列数占比均为6%,物种信息分别为Firmicutes的葡萄球菌属(Staphylococcus)和乳酸乳球菌属(Lactococcus)的乳酸乳球菌(Lactococcus lactis)。OTU 3包含序列占比为3%,物种信息为变形菌门(Proteobacteria)假单胞菌属(Pseudomonas)的莓实假单胞菌(Pseudomonas fragi)。OTU 7包含序列占比为3%,属于蓝细菌门(Cyanobacteria)生物。OTU 4、OTU 12、OTU 9、OTU 6各自包含的序列数占比均为2%,其中OTU 4、OTU 12分别为Firmicutes的魏斯氏菌属(Weissella)和肠球菌属(Enterococcus),O T U 9、O T U 6分别为Proteobacteria不动杆菌属(Acinetobacter)的约氏不动杆菌(Acinetobacter johnsonii)和Anaplasma属的Anaplasma ovis。OTU 8、OTU 13、OTU 10、OTU 11序列数占比均为1%,其中OTU 13为Proteobacteria,其余OTU 8、OTU 10、OTU11均为Firmicutes。由以上分析可知,样品中微生物丰度高的物种主要集中在Firmicutes和Proteobacteria。Firmicutes中以Lactobacillus sakei为最高,其次为Staphylococcus和Lactococcus lactis。