《表1 小黑杨基因组比对注释统计》
为了检测gDNA提取时是否混有细菌等污染,同时对拼接结果进行初步分析,我们将contig长度不小于2 000 bp的22 634条序列与最新的Nt数据库进行比对。对所有的query物种注释信息进行统计。结果显示,比对注释到的物种共有240个,总计17 804次。其中注释得到最多的是毛果杨,共有12 010次成功比对,其次是胡杨(Populus euphratica),有3 038次成功比对,而比对数最多的前10个物种的总注释数占全部注释物种次数的92.08%(表1)。从注释的结果看,小黑杨基因组与毛果杨高度相似,其次是胡杨,与其为黑杨派与青杨派的杂交种起源相符。
图表编号 | XD0037809000 严禁用于非法目的 |
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绘制时间 | 2019.01.01 |
作者 | 周玉敏、王遂、刘轶、李开隆、由香玲 |
绘制单位 | 湖北生态工程职业技术学院、东北林业大学林木遗传育种国家重点实验室、东北林业大学林木遗传育种国家重点实验室、东北林业大学林木遗传育种国家重点实验室、东北林业大学林木遗传育种国家重点实验室 |
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