《表1 芥菜型油菜遗传连锁图谱统计信息》

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《芥菜型油菜A9染色体物理图谱构建和结构变异分析》


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基于172个RIL单株及2个亲本,将原始测序数据筛选过滤后,在21 210个GBS测序位点上共开发53 615个标记,其中SNP标记为51 018个,InDel标记2 597个。为了提高划分连锁群的准确性,共筛选了15 543个等位基因频率大于等于0.15或缺失基因型比例小于等于0.4的标记,定位在18条染色体上,遗传图长为1 526.8 cM,平均每条染色体有863个标记,标记密度为0.751 c M(表1)。将遗传位置相同的标记划分为一个标记簇(bin),共得到2 085个标记簇,组成芥菜型油菜遗传图谱,其中A9染色体共有1 841个GBS标记,形成232个标记簇,遗传长度为122.059 cM,标记密度为0.528cM。以每个标记簇的第一个遗传标记为代表,构建芥菜型油菜遗传图谱。