《表1 苦瓜遗传连锁图谱：苦瓜遗传连锁图谱构建的研究现状与比较分析》

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《苦瓜遗传连锁图谱构建的研究现状与比较分析》

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Matsumura等[12]为了鉴定与纯雌性基因连锁的分子标记，利用RAD-seq分析技术检测基因组范围的DNA多态性，利用纯雌性系OHB61-5和雌雄同株系OHB95-1A杂交产生的F2群体对多态性位点进行基因型分析，基于552个共显性的RAD-tag标记构建了苦瓜连锁图谱，共包括15个连锁群，图谱全长1 821 cM（表1）。纯雌性位点Mcgy被定位在第一连锁群的末端，与Mcgy最近的标记为GT1998，该标记由一个等位性标签组成，该SNP在OHB61-5中为C类型，在OHB95-1A中为T类型，GT1998与Mcgy位点的遗传距离为8.33 cM。为了进一步开发与纯雌性紧密连锁的标记，构建了纯雌性系混池和雌雄同株系混池，结合亲本池，基于RAD-seq技术确定了与纯雌性位点紧密连锁的SNP标记GTFL-1，该标记与Mcgy位点的遗传距离为5.46 cM。本图谱包括的标记数量显著高于张长远[8]、Wang等[9]、米军红[10]和Kole等[11]构建的图谱，图谱的密度显著提高。但是在该研究中，连锁群的数目（15个连锁群）并没有覆盖已知的染色体数目（11条染色体），一些连锁群只包含有限的标记数量。这些结果很可能是由于标记位置在分析群体中存在偏差，或者相同染色体上的连锁群存在分离。为了解决这些问题，有必要增加标记密度或更换作图群体。在RAD-seq分析时采用不同限制性内切酶可能会增加标记的数量。另外，增加F2个体的数量将有助于绘制精确的连锁图谱。然而，当一个作图群体的双亲序列差异较小时，通过更换限制酶或增加群体规模来精确定位纯雌性基因也是很困难的。