《表1 多年生黑麦草遗传连锁图谱的构建》

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《多年生黑麦草分子标记应用及基因组研究进展》


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多年生黑麦草遗传连锁图谱中,发掘春化相关基因的遗传连锁图谱研究较为深入,最初开发的图谱长度为490.4 cM,标记间平均距离为5 cM,主要为93个AFLP标记及SSR标记(Jensen et al.,2005)。后续增加了SNP标记,使图谱总长度增加到750 cM,不仅可用于表征春化反应,和评估种子产量及生育力特征(Studer et al.,2012),也可用于定位涉及水分胁迫的基因位点(Jonaviciene et al.,2012)。此外,DA-rT标记(Tomaszewski et al.,2012;Harper et al.,2018)、EST-SSR标记(Studer et al.,2010)、SNP标记(Cogan et al.,2006)在多年生黑麦草遗传连锁图谱构建中均有所应用,特别是高密度的SNP标记,为遗传图谱构建、连锁不平衡研究提供了重要依据。Velmurugan等(2018)先后构建了具有9 166个SNPs标记的高密度遗传连锁图。随着构建多年生黑麦草遗传连锁图谱精确度的提高,基于图谱的基因定位与克隆的研究也更加深入(Wangand Forster,2017)。不同分子标记在多年生黑麦草遗传连锁图谱构建中的应用不同(表1)。