《表2 不同种类添加剂溶液体系的组成》
初步筛选添加剂后,建立尿素晶面-过饱和溶液界面模型进行MD模拟,MD模拟方法采用Gromacs5.0.5[18]软件包,力场采用Amber99SB-ildn[19]分子力场,水分子使用Tip4p模型[20]。模拟过程中,时间步长设定为2 fs,静电相互作用的远程修正采用PME(Particle Mesh Ewald)法[21]。体系压力采用Berendsen法[22]控制在101.325 kPa,温度控制使用Velocity-rescal法[23]设定为290 K。建立尿素过饱和度[24]为0.134溶液体系(3.3 nm×3.0 nm×14.5 nm),对每个体系在底部添加同一尿素晶层(252个尿素分子),作为晶种,溶液层由40个添加剂分子、1000个尿素分子以及近1300个水分子组成,各体系组成如表2所示。另外将无添加剂的尿素过饱和溶液体系作为参考体系。体系构建完成后,首先,限制住尿素晶层的位置坐标,均采用最陡下降算法设置步数为50000步优化结构至收敛,随后在NPT系综下进行1 ns平衡溶液体系,最后在相同系综下对各体系进行100 ns的MD模拟。
图表编号 | XD0033387800 严禁用于非法目的 |
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绘制时间 | 2019.01.01 |
作者 | 蔡惊涛、李代禧、刘宝林、栾翰森、郭柏松、魏冬青、王浩 |
绘制单位 | 上海理工大学食品科学与工程研究所、上海理工大学食品科学与工程研究所、上海理工大学食品科学与工程研究所、中国医药工业研究总院、上海东富龙科技股份有限公司注射剂实验室、上海交通大学微生物代谢国家重点实验室、中国医药工业研究总院 |
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