《表2 生物信息学在线分析软件汇总》

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《菊叶香藜精油合成关键HMGR基因的生物信息学分析》

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运用Gen Bank的在线软件ORF Finder和本地软件Jellyfish 2.0查找开放阅读框（ORF）；利用在线软件Prot Param分析蛋白质的理化性质；运用在线分析软件Prot Scale分析蛋白质亲/疏水性；运用在线SOPMA软件分析和预测蛋白质氨基酸序列二级结构；运用在线工具Signal P 4.1分析蛋白质信号肽；利用在线程序TMHMM进行蛋白质跨膜结构域的预测；运用在线软件Cell-PLoc 2.0分析蛋白质亚细胞定位；采用在线工具CDD（Conserved domain datebase）预测蛋白质的保守结构域；蛋白质三维结构以人类HMGR蛋白（PDB ID:3CD0）为模板，利用Phyre2进行三维结构同源建模；利用本地软件Clustalx进行多条氨基酸序列比对；利用本地软件MEGA 5.0构建Neighbor-joining系统进化树，相关在线生物信息学分析软件如表2所示[16]。