《表2 生物信息学在线工具及其网址Table 2 Software online of bioinformatics and its websites》
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《牛樟芝中一个新型还原型聚酮合酶基因的克隆及表达分析》
利用NCBI上的在线程序ORF Finder对Ac PKS2基因进行开放阅读框预测,BLAST程序进行序列同源性比较,Prot Param进行蛋白质理化性质(等电点、分子量)分析,用Signal P 4.1 server预测信号肽的有无,用Target P预测其亚细胞定位,用NCBI中的Conversed Domain Database数据库搜索Ac PKS2蛋白的结构功能域。选取与牛樟芝Ac PKS蛋白质序列同源性较高的其他真菌的PKS蛋白序列一起,用MEGA 6.0软件进行氨基酸序列同源性分析及系统发育分析,进行Clustal W程序比对后,采用Neighbor-Joinging程序构建进化树,1 000次重复,其他参数选用默认值。生物信息学所用在线工具及其网址见表2。
图表编号 | XD0022854300 严禁用于非法目的 |
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绘制时间 | 2018.09.01 |
作者 | 原晓龙、华梅、陈剑、王娟、杨宇明、王毅 |
绘制单位 | 云南省林业科学院云南省森林植物培育与开发利用重点实验室国家林业局云南珍稀濒特森林植物保护和繁育重点实验室、云南省林业科学院云南省森林植物培育与开发利用重点实验室国家林业局云南珍稀濒特森林植物保护和繁育重点实验室、云南省林业科学院云南省森林植物培育与开发利用重点实验室国家林业局云南珍稀濒特森林植物保护和繁育重点实验室、云南省林业科学院云南省森林植物培育与开发利用重点实验室国家林业局云南珍稀濒特森林植物保护和繁育重点实验室、云南省林业科学院云南省森林植物培育与开发利用重点实验室国家林业局云南珍稀濒特森林植物保 |
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