《表2 生物信息学在线工具及其网址Table 2 Software online of bioinformatics and its websites》

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《牛樟芝中一个新型还原型聚酮合酶基因的克隆及表达分析》


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利用NCBI上的在线程序ORF Finder对Ac PKS2基因进行开放阅读框预测,BLAST程序进行序列同源性比较,Prot Param进行蛋白质理化性质(等电点、分子量)分析,用Signal P 4.1 server预测信号肽的有无,用Target P预测其亚细胞定位,用NCBI中的Conversed Domain Database数据库搜索Ac PKS2蛋白的结构功能域。选取与牛樟芝Ac PKS蛋白质序列同源性较高的其他真菌的PKS蛋白序列一起,用MEGA 6.0软件进行氨基酸序列同源性分析及系统发育分析,进行Clustal W程序比对后,采用Neighbor-Joinging程序构建进化树,1 000次重复,其他参数选用默认值。生物信息学所用在线工具及其网址见表2。