《表2 生物信息学研究的数据库和软件网站》

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《香蕉条斑病毒ORF Ⅰ基因克隆及编码蛋白和同源物的生物信息学分析》

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由于BSV-YN ORFⅠ和其他10种ORFⅠs同源蛋白的功能尚不清楚，因此，本研究利用生物信息学分析它们的基本特征和预测可能的蛋白功能。利用在线网页ExPASy Proteomic的ProtParam tool程序分析BSV-YN ORFⅠ蛋白和10种同源物的分子质量、等电点和氨基酸组成等理化性质；利用在线网页EMBL的SMART程序和NCBI的Conserved Domain程序预测蛋白质的同源结构域；利用ProtScale在线工具分析蛋白质的亲疏水性；利用SOPMA在线工具预测蛋白的α-螺旋、β-折叠及其他二级结构；利用在线软件TMHMM 2.0Server预测蛋白质的跨膜结构域区域；利用SignalP4.1 Server在线工具对蛋白质的信号肽区域进行预测；利用PSORTII在线工具预测蛋白质可能的亚细胞定位结果；利用NetPhos 3.1 Server在线工具分析蛋白质潜在的磷酸化位点；利用SWISS-MODEL软件在线预测蛋白质三级结构（表2）。