《表1 本研究使用的生物信息学在线软件》

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《基于双荧光素酶报告基因系统的人源SREBP1基因启动子的活性研究》


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选取SREBP1(Ensembl:ENSG00000072310)基因起始密码子上游5 000 bp序列,利用在线软件NNPP、Prometer SCAN、TSSG、TSSW和Nsite在默认条件下对SREBP1基因启动子序列及其转录因子结合位点进行预测分析。分别在CpGFinder、MethPrimer、MethPrimer 2.0和CpGPlot四个软件上传获取的基因序列,按照默认条件进行CpG岛预测分析。将Cister软件阈值设置为0.1,对SREBP1基因顺式元件进行预测,并得出相应结果。本研究使用的在线软件见表1。