《表1.12个最大的CRISPR重复序列类别》

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《极端酸性矿山环境微生物基于CRISPR系统的适应性免疫机制》

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重复序列分类结果表明，同属内菌株的重复序列能够分布于不同类别中，形成不同的RNA二级结构，如Acidithiobacillus和Sulfobacillus。Acidithiobacillus广泛存在于矿坑水、沉积物和生物膜等环境中[26]，而Sulfobacillus在p H 0.8–1.4，27–32°C环境中约占微生物群落的6%–8%[27]，其基于CRISPR-Cas系统发挥核酸免疫作用来适应环境变化时可能具有多样性。此外，不同属菌株的重复序列可分布于同一类别中，表现出较高的同源性，如Cluster 12中的重复序列来自细菌Sulfobacillus与古菌Ferroplasma，研究表明这两个属的菌株可能在极端条件下协同参与矿物的氧化性溶解过程[26]，推测菌株的亲缘关系和CRISPR同源性不是直接对应的，可能与CRISPR结构序列的水平基因转移有所关联[28]。