《表4 翼首草及17类植物SQS蛋白二级结构主要构成组件比例》

《表4 翼首草及17类植物SQS蛋白二级结构主要构成组件比例》   提示:宽带有限、当前游客访问压缩模式
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《藏药翼首草角鲨烯合成酶的生物信息学分析》


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注:阿拉伯数字Ⅰ~ⅩⅦ指代将25种植物按进化树分析划分为的17个类群

蛋白质二级结构是指蛋白质多肽链的氨基酸残基通过氢键的折叠与盘绕而形成的α-螺旋、β-折叠结构、延伸链及无规则卷曲等组件,其中最常见的是α-螺旋和β-折叠(龙芳等,2013)。采用SOPMA(Geourjon and Deléage,1995)对翼首草等34种植物128条SQS蛋白序列的二级结构进行预测(表4),结果显示,翼首草Ph SQS蛋白二级结构的主要结构元件是α-螺旋(67.15%)和无规则卷曲(21.82%),其次是延伸链(6.71%)和β-折叠(4.32%)。蛋白二级结构的预测与分析结果显示,其他植物中SQS蛋白的二级结构与Ph SQS蛋白二级结构相似,主要由α-螺旋、无规则卷曲、延伸链和β-转角组成。其中α-螺旋含量所占比例最高。