《表3 系统进化树中的植物SQS蛋白信息对照表》

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《基于转录组测序黑老虎角鲨烯合酶基因克隆和生物信息学分析》


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利用NCBI对KcSQS氨基酸序列进行Blast,共挑选相似性较高的44个植物SQS序列,蛋白序列信息见表3。用MEGAX软件中的ClustalW对这些SQS氨基酸序列进行多序列比对,构建Neighbor-joining系统发育进化树,利用FigTree v1.4.3对其进行修饰美化,结果如图5。该进化树共分为两大支,一支为单子叶植物,另一支为双子叶植物,且植物来源为同科属的SQS遗传距离较近,KcSQS与无油樟角鲨烯合酶(AtSQS),厚朴角鲨烯合酶(MoSQS),柳叶蜡梅角鲨烯合酶(CsSQS1)聚为一支,序列相似度分别为75.68%、76.77%、75.98%,显示KcSQS与其具有较高的相似性,见图5。