《表3 系统进化树中的植物SQS蛋白信息对照表》
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《基于转录组测序黑老虎角鲨烯合酶基因克隆和生物信息学分析》
利用NCBI对KcSQS氨基酸序列进行Blast,共挑选相似性较高的44个植物SQS序列,蛋白序列信息见表3。用MEGAX软件中的ClustalW对这些SQS氨基酸序列进行多序列比对,构建Neighbor-joining系统发育进化树,利用FigTree v1.4.3对其进行修饰美化,结果如图5。该进化树共分为两大支,一支为单子叶植物,另一支为双子叶植物,且植物来源为同科属的SQS遗传距离较近,KcSQS与无油樟角鲨烯合酶(AtSQS),厚朴角鲨烯合酶(MoSQS),柳叶蜡梅角鲨烯合酶(CsSQS1)聚为一支,序列相似度分别为75.68%、76.77%、75.98%,显示KcSQS与其具有较高的相似性,见图5。
图表编号 | XD0088104200 严禁用于非法目的 |
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绘制时间 | 2019.07.25 |
作者 | 王丽君、李艳青、谢舒平、石雨荷、朱敏、童巧珍、段礼新 |
绘制单位 | 湖南中医药大学、广州中医药大学、南京中医药大学、湖南中医药大学、广州中医药大学、湖南中医药大学、湖南省岳阳市中医院、广州中医药大学 |
更多格式 | 高清、无水印(增值服务) |