《表3 金虎尾目在NJ系统发育树中的汇总》

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《基于线粒体DNA序列分析金虎尾目在蔷薇亚纲中的地位》

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注：Malpighiales+Fabidae表示金虎尾目属于豆类分支；Malpighiales+Malvidae表示金虎尾目属于锦葵类分支。Malvidae+Fabidae表示金虎尾目既不属于锦葵类也不属于豆类。

本实验中近邻法使用的模型是Maximum Composite Likelihood model，该模型可以准确地估计成对距离和相关的替代参数。12条同源基因用近邻法构建系统发育进化树结果如表3。nad7中得出2种亲缘关系如图1，从亲缘关系上看来豆类仅有Ammopiptanthus mongolicus与金虎尾目类群接近，但支持率为19%。总体上看来，金虎尾目与锦葵目属于一个分支，与锦葵目的关系更加亲近。近邻法表示8条基因中有14%～82%的支持率表明金虎尾目属于锦葵类，包括nad7基因，支持率较高的是atp4达到82%。只有3条基因表明金虎尾目属于豆类，支持率范围较低36%～66%。此方法中也出现了金虎尾目属于豆类和锦葵类分支之外的情况，图2为基因cox1的近邻法进化树结果，从进化树分支上看来，金虎尾目比锦葵目和豆目都先分化出来，锦葵目和豆目属于一个分支，但支持率可信度不高，仅有44%。