《表2 系统发育分析中的重要问题》
在利用草图基因组序列建树时,首要的是对基因组序列的质量(尤其是污染度和株系异质性)进行评估在宏基因组学普及以前,微生物基因组主要是通过纯培养获得的(表2).近年来,利用宏基因组鸟枪法和单细胞测序技术,已产生了大量的未培养的微生物基因组数据(Rinke等,2013;Tully等,2018).与纯培养获得的基因组相比,对这些组装基因组讨论最多的是:不完整性;存在嵌合现象;存在污染;同时还有基因组的异质性等问题.
图表编号 | XD0066546800 严禁用于非法目的 |
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绘制时间 | 2019.07.20 |
作者 | 肖静、范陆、吴顶峰、徐雁冰、赖登训、William F.MARTIN、朱瑞新、张传伦 |
绘制单位 | 同济大学生物信息系、南方科技大学深圳海洋地球古菌组学重点实验室、南方科技大学前沿与交叉科学研究院、同济大学生物信息系、同济大学生物信息系、南方科技大学深圳海洋地球古菌组学重点实验室、Institute for Molecular Evolution,University of Düsseldorf、同济大学生物信息系、南方科技大学深圳海洋地球古菌组学重点实验室、南方科技大学深圳海洋地球古菌组学重点实验室、青岛海洋科学与技术国家实验室海洋地质过程与环境功能实验室 |
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