《表3 SRAP-PCR正交试验设计L16(45)》

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《薰衣草SRAP-PCR反应体系的建立及优化》


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选用薰衣草“GS1”样本、引物ME1em2进行正交试验。试验结果表明,在16个组合中,第16个组合扩增效果明显较好(图2)。参照何正文等(1998)的打分方法,根据条带的清晰度、明亮度及数量来评分,结果最好的16分,结果最差的1分,各16个组合扩增反应体系(表3)得分依次为10、10、1、11、12、12、11、11、11、12、12、12、12、13、16和16。从电泳结果可以得出,第15和16泳道的条带清晰且数量丰富,表明这2个组合多态性高,均可以作为薰衣草正交试验组合,但第16个组合的多态性条带比第15个组合清楚,所以最终选择第16个组合作为薰衣草SRAP-PCR最优反应组合。在25μL总体系中d NTPs浓度0.32 mmol/L、引物浓度0.24μmol/L、DNA模板量60 ng、Taq DNA聚合酶用量0.4 U、镁离子浓度3.0 mmol/L。