《表1 海南油茶SRAP-PCR L16(45)正交试验设计》

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《海南油茶SRAP-PCR体系优化及有效引物筛选》


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采用直观分析法,按照遗传多样性分析要求,以条带的强弱、丰富度以及背影的清晰度对每个组合的扩增结果进行打分,16个组合的分数依次为1、10、8、15、8、11、5、8、9、12、12、1、6、1、13、14。其中,组合4的分值最高,为15分,其扩增条带总数为10条。因此,组合4为海南油茶SRAP-PCR最佳反应组合,即总体系为20μL,最佳反应体系中模板DNA用量为5 ng,dNTPs浓度为0.20 mmol/L,引物浓度为0.60μmol/L以及Taq DNA聚合酶用量为4.00 U(表1)。