《表1 不同样品的代表性序列及微生物多样性》

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《应用Illumina MiSeq测序技术比较传统发酵乳、肉食品中细菌多样性》

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由表1所示，所有样品的覆盖率均大于99%，说明样品文库的覆盖率很大，可反映本测序结果代表样本的真实情况。在发酵制品中，Shannon指数大，Simpson指数小，表明样本菌群多样性指数高[14]。发酵肉制品平均Shannon和Simpson指数分别为3.0和0.2，发酵乳制品平均Shannon和Simpson指数分别1.6和0.4。试验中发酵肉制品与发酵乳制品相比，Shannon指数大，Simpson指数小。通过Chao1指数对样品中微生物的丰富度进行评估，Chao1指数越大样品中菌群丰富度越高。发酵肉制品中Chao1指数平均值为157，发酵乳制品为109。由此可知，肉制品中细菌多样性和丰富度均高于发酵乳制品。