《表2 WS-JX株与各参考毒株HA蛋白关键位点的比较》
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《江西地区H9亚型禽流感病毒WS-JX株的分离鉴定》
将WS-JX株的HA基因序列上传至NCBI Blast,比对结果显示其与Gen Bank上的ZS03株的核苷酸序列相似性最高,达到99.6%。运用DNAStar软件对WS-JX株的HA基因进行核苷酸序列分析,结果表明HA序列含有一个长度为1 683个核苷酸的阅读框架,预计编码560个氨基酸。根据序列测定的HA序列所推导的氨基酸序列分析显示,WS-JX株的HA蛋白中含有29NST、141NVS、298NTT、305NVS、313NCS、492NGT、551NGS这7个潜在的糖基化位点。受体结合位点的氨基酸分别为109Y、161W、163T、191N、198T、202L、203Y,而第226位氨基酸位L,为哺乳动物受体结合位点的特征氨基酸[4]。裂解位点(335-343位)的氨基酸序列为PSRSSR GLF,裂解位点附近均无连续碱性氨基酸插入,仅能被有限的细胞蛋白酶识别,符合低致病性AIV的分子特征[5,6](见表2)。基于WS-JX株与Gen Bank中的H9亚型AIV参考毒株、国内常用疫苗株以及近年来流行毒株的HA基因核苷酸序列,利用MEGA7.0软件绘制系统进化树(见图2)。遗传进化分析结果表明,WS-JX株属于4.2.5分支,与ZS03株的亲缘关系最近,与DG4254等近年来流行毒株处于同一进化分支;而国内常用疫苗株F、SS与BJ94株同属4.2.3分支。分离的WS-JX株所处的4.2.5分支同属4.2这一大分支,但2个分支之间有一定的遗传距离[7,8]。
图表编号 | XD00214649700 严禁用于非法目的 |
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绘制时间 | 2018.11.05 |
作者 | 何柳芬、钟植文、黎先伟、刘镇明、杨傲冰 |
绘制单位 | 广东永顺生物制药股份有限公司、广东永顺生物制药股份有限公司、广东永顺生物制药股份有限公司、华南农业大学兽医学院、广东永顺生物制药股份有限公司 |
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