《表4 应用Bio Edit 4.8.10获得JZ株和疫苗株Rotarix、Rota Teq VP4四个抗原表位区8-1、8-2、8-3和8-4对应的25个氨基酸比对结果》

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《2018–2020年人轮状病毒锦州地方株VP4及VP7基因特征》

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注：*：相同氨基酸。S：丝氨酸；E：谷氨酸；N：天冬酰胺；D：天冬氨酸

JZ RVA（除JZ1810及JZ1901外）VP4氨基酸序列相似性为99.19%-100%，与Rotarix及Rota Teq VP4做相似性比较，检测到5个JZ株特异氨基酸突变位点：JZ1811、JZ1812、JZ1903 （S146G，M630V）、JZ1911 （L697F，P701S）、JZ2001（I744S）。VP4是RVA外衣壳上刺突蛋白，在感染宿主细胞过程中被胰酶裂解为2个亚单位蛋白，氨基端VP8*（28 k D，aa1-247）及羧基端VP5*（60 k D，aa248-776），分别介导病毒的吸附和穿入[3]。VP8*在病毒体表面形成球状头部，包含4个（8-1、8-2、8-3和8-4）表面暴露抗原表位，含25个氨基酸[23]，是轮状病毒亚单位疫苗候选株靶位蛋白[24]。5株P[8]型JZ株VP8*的4个抗原表位与Rotarix比较在146、150、195、113、125、131、135共有7个氨基酸差异，而与Rota Teq有146、150、195、113共4个氨基酸差异，均分布于8-1、8-3 （表4）。