《表3 应用Bio Edit 4.8.10获得JZ株和疫苗株Rotavac-116E/AG、Rotasiil-AU32 VP7 3个抗原表位区7-1a、7-1b和7-2对应的29个氨基酸比对结果》

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《2018–2020年人轮状病毒锦州地方株VP4及VP7基因特征》

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注：*：相同氨基酸。I：异亮氨酸；G：甘氨酸；N：天冬酰胺；A：丙氨酸；D：天冬氨酸；T：苏氨酸

轮状病毒VP7编码由326个氨基酸构成的三聚体糖蛋白，分子量为37 k D，是中和性抗体的主要靶标[3]。野毒株VP7抗原表位处的氨基酸变异形成免疫逃逸可干扰疫苗的有效性。7个JZ株VP7氨基酸序列相似性为99.35%-100%，其中JZ1811、JZ1812、JZ1903序列完全相同。研究表明，VP7三聚体含有2个抗原表位7-1和7-2，7-1表位进一步细分为7-1a和7-1b[22]。应用Bio Edit将7株JZ RVA VP7氨基酸序列之间及2种疫苗株Rotavac和Rotasiil的相应序列进行比较（表3），检测到3个JZ株特异性氨基酸位点变异，分别是JZ1901 （G54E），JZ2001 （T75I），JZ1811、JZ1812和JZ1903 （P112S），均为3个抗原表位之外。在这些表位的29个氨基酸残基中，24个在所有JZ株及Rotavac和Rotasiil中绝对保守，5个氨基酸位点有差异。与Rotavac G9 VP7相比，JZ株替换位点为I87T、G100N、N145D和N221S，与Rotasiil相比为A87T、D100N和T242N。2种疫苗株Rotavac和Rotasiil未曾在国内使用，这些变异并非疫苗选择性压力造成，而是自然选择点突变。