《表1 ld11分离株和4株人源参考菌株的耐药基因检测结果》
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《宁夏地区一株奶牛源耐甲氧西林金黄色葡萄球菌流行株的高通量测序分析》
将通过Illumina高通量测序技术得到的序列进行拼接组装,通过cge网络数据库(https://cge.cbs.dtu.dk/services/cge/)和Glimmer 3.02软件分析得出试验菌株ld11的基因数量为2 699个,基因总长度为2 408 730 bp,基因平均长度为892 bp,基因区域(G+C)mol%含量为33.4%,基因占基因组百分比为83%,遗传区域长度为494 727 bp,遗传区域的(G+C)mol%含量为28.8%,分离株ld11基因组和4株MRSA参考菌株基因组均携带多种不同的耐药基因(表1),分离株ld11携带有氨基糖苷类耐药基因aadD、spc和str,β-内酰胺类耐药基因blaZ和mecA,酰胺醇类耐药基因cat(pC194),大环内酯类耐药基因erm(A),氟喹诺酮类耐药基因norA,以及四环素类耐药基因tet(k)和tet(M),分离株ld11携带耐药基因数较多于4种参考菌株(表1)。对分离株ld11和4株人源MRSA参考基因组基于核心基因组的进化树构建结果如图1所示,结果表明分离株ld11和参考菌株MRSA252亲缘关系较近,与参考菌株MW2、N315及Mu50亲缘关系相对较远。
图表编号 | XD0078220200 严禁用于非法目的 |
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绘制时间 | 2019.07.20 |
作者 | 陈程、王曈、常佳伟、万佳宏、王桂琴 |
绘制单位 | 宁夏大学农学院、宁夏大学农学院、宁夏大学农学院、宁夏大学农学院、宁夏大学农学院 |
更多格式 | 高清、无水印(增值服务) |