《表1 不同碳源条件下15个差异显著CAZyme基因》

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《不同碳源条件下广叶绣球菌转录组分析》

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通过在线软件dbCAN2 meta server对差异基因进行碳水化合物活性酶功能注释。在纤维素为碳源的处理中，差异表达显著的碳水化合物活性酶基因共有25个（上调基因23个，下调基因2个；其中13个基因含有信号肽），包含21个糖苷水解酶、2个糖基转移酶和2个碳水化合物酯酶；在纤维素和木质素为碳源的处理中，差异表达显著的碳水化合物活性酶基因共有40个（上调基因36个，下调基因4个；其中19个基因含有信号肽），包含28个糖苷水解酶、8个糖基转移酶和4个碳水化合物酯酶；在松木屑为碳源的处理中，差异表达显著的碳水化合物活性酶基因共有47个（上调基因43个，下调基因4个；其中22个基因含有信号肽），包含35个糖苷水解酶、7个糖基转移酶和5个碳水化合物酯酶（图5）。从差异基因数量上可以看出，随着所利用碳源复杂程度的增加，碳水化合物活性酶基因的表达受诱导表达的数量也在增加，更多的基因参与了复杂碳源的利用过程。根据各样品组中差异表达的碳水化合物活性酶基因表达量（FPKM值）构建热图并进行聚类分析，从图6聚类分析中可以看出，A和B分支基因表达量丰度在3个处理组中较高，其中差异基因在任一组中上调超过4倍的有15个（表1）。从表1中可以看出涉及半纤维素降解的相关基因上调幅度最大，如内切1，4-β-甘露糖苷酶（Endo-1，4-β-mannosidase）、α-半乳糖苷酶（α-galactosidase）等。同时纤维素降解相关的内切β-1，4-葡聚糖酶（Endo-β-1，4-glucanase）、β-葡萄糖苷酶（β-glucosidase）在3个诱导处理组中也表现了上调。